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2022 年 8 月 31 日,在最新的 Nature 上在线发布了一项极其重磅的研究进展:研究人员使用高度工程化的酵母,微生物从头合成了抗癌药物长春碱的前体:文多灵(vindoline)和长春质碱(catharanthine)。 该项研究展示了一条非常非常长的生物合成途径:从酵母的天然代谢产物香叶基焦磷酸(geranyl pyrophosphate)和色氨酸(tryptophan)到文多灵和长春质碱,期间总共涉及到 30 个酶促反应步骤!这,也是目前从植物转移到微生物的最长的生物合成途径! 从头微生物合成文多灵和长春质碱(来源:Nature) 为了实现这一超长生物合成途径在酵母细胞当中的重构,研究人员总共在酵母细胞中创纪录地使用了多达 56 次的基因编辑,这其中便包括了:表达 34 个植物来源的异源基因,以及删除、敲低和过表达 10 个酵母基因。 而带来这项研究的,正是合成生物学产业化先驱、美国工程院院士 Jay D. Keasling,以及其领导的丹麦技术大学(DTU)诺和诺德基金会生物可持续性研究中心的研究人员。 “由于长春碱途径是最长的单萜吲哚生物...
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糖类分子是生命的基本物质,参与了生命活动的几乎所有环节,发挥着各种重要的生物学功能。基于糖的广泛生物学功能而开发的糖类药物则具有广泛的治疗作用,长期以来都是药物研究的重要领域。自2000年以来,糖化学、糖生物学和糖化学生物学领域迅猛发展,为糖类药物的研究与开发带来了众多机会,糖类药物研究进入繁荣期。但鉴于糖类分子结构的复杂性和药理活性的多样性等因素,领域内尚无系统性论著对相关内容进行总结。 近日,《药学学报》英文刊Acta Pharmaceutica Sinica B (APSB)在线发表了复旦大学附属中山医院曹鑫教授团队和中国科学院上海有机化学研究所俞飚院士团队倾情奉献的超级综述论文《2000-2021年上市的糖类药物》。该综述对主要专利药物法规市场在过去20年间上市的54种糖类药物进行了全面梳理和系统总结,可望为未来糖类药物的研发提供诸多有益启示。 据统计, 2000-2021 年,在主要专利药物法规市场共有54 种含糖结构药物上市。论文按照药物的适应症进行了系统性分类,并在各章节中对相关药物的化学结构、生物活性和临床试...
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1:完整测序的人类基因组 当加州大学圣克鲁兹分校的基因组学研究人员Karen Miga和马里兰州贝塞斯达国家人类基因组研究所的Adam Phillippy于2019年启动了端粒-端粒(T2T)联盟时,大约十分之一的人类基因组仍未知数。现在,这个数字已经降至零。在去年5月发表的一份预印本中,该联盟报告了人类基因组的第一个端到端序列,为被广泛使用的被称为GRCh38的人类共有基因组序列增加了近2亿个新碱基对,并撰写了人类基因组计划的最后一章。 GRCh38于2013年首次发布,一直是一个有价值的序列工具,但由于读数较短,不足以明确地绘制高度重复的基因组序列图谱,包括端粒和在细胞分裂过程中协调新复制DNA分配的着丝粒。长读数测序技术由位于加州门洛帕克的Pacific Biosciences和位于英国牛津的Oxford Nanopore Technologies(ONT)开发,这些技术可以在单次读取中对数万甚至数十万个碱基进行测序。这些像指纹一样的微小变异让他们能够追踪不同的重复序列,完成对剩余基因组的测序。ONT平台还捕获了许多调节基因表达的DNA修饰,T2T也能够在全基因组范围...